（一）办公室。负责单位日常运转及综合协调工作；承担政务信息、机要保密、应急管理、来信来访、后勤服务等工作；负责党建群团、机构编制、干部人事、教育培训及离退休干部工作；负责党风廉政、绩效考核和作风效能建设等工作。

（二）财务科。负责编制全市基金预决算草案、财务统计报表；负责医疗保险、医疗救助、长期护理保险等结算费用的审核拨付及会计核算；负责基金运行的统计分析、预测预警；负责本单位行政经费的支付、管理及会计核算。

（三）基金结算科。参与研究、草拟医疗、生育、长期护理保险费用结算管理办法及实施细则；负责定点医药机构医疗费用总量指标的管理工作；负责医疗、生育、长期护理、补充商业保险费用结算管理工作，负责医保目录维护管理工作；协助推进医保支付方式改革；负责异地就医联网划卡医疗费用的结算工作；负责医疗救助专项资金的结算工作。

（四）稽核科。负责对定点单位、医保医师、医保服务及参保人员社保卡使用情况进行监督、检查，依据协议对违反医保政策、服务协议行为进行查处；负责对医保服务数据进行监控、筛查和分析；负责开展大额医疗费用评审工作；负责对涉及医保举报投诉的受理和查处。

（五）医疗管理科。参与医保政策待遇调整的调研、文件修订等相关工作；负责相关单位申请纳入协议管理及日常管理、相关编码信息维护等工作；负责定点单位诚信等级管理工作；负责医保医师管理工作；负责定点单位考核工作；受理本市定点医药机构纳入异地就医申请；负责协调商业补充医疗保险的组织实施及日常考核管理。配合全市医疗保障信息化建设实施；承担医疗保障信息系统及网络运维管理；负责全市医疗保障数据管理、网络信息安全、信息突发事件处置。

（六）参保业务科。负责职工基本医疗保险（生育保险）、居民医疗保险、长期护理保险以及公务员医疗补助、医疗救助对象等各类医疗保障的参保管理；负责参保单位和个人基本信息登记、缴费基数审核、个人权益记录管理；承担基本医疗保险关系转移接续；核定各项保险缴费年限；负责建立个人医疗账户；负责对参保缴费情况组织监督检查；承办窗口业务下沉医院、镇（园区）的相关工作；负责相关医疗保障业务窗口服务工作。

（七）医疗服务科。负责各类参保人员的待遇（零星报销）业务；负责门诊特定项目、特药等待遇审核登记及相关经办管理工作；负责生育津贴等待遇的审核发放工作；负责牵头落实国家、省异地就医政策，负责异地就医经办管理；负责异地就医结算相关平台管理对接，协调解决异地就医各类问题；协助稽核部门做好医疗保险监督稽核工作；承办窗口业务下沉医院、镇（园区）的相关工作。负责相关医疗保障业务窗口服务工作。

（八）长期照护保险科。负责贯彻落实长期护理保险政策；负责长期护理保险基金运行情况的统计与分析工作；加强照护定点机构、第三方经办机构管理、考核与指导，负责长期护理保险待遇业务经办管理。

（九）审计科（档案管理科）。负责牵头完善医疗保障经办业务操作规范；建立健全经办业务风险管理制度；组织实施内部审计和第三方服务审计工作；负责医疗保障经办业务内控管理和规范化检查等基本医疗保障内控管理相关工作。负责档案管理工作，接收、整理、分类、鉴定、保管、统计、利用各类档案及有关资料；负责档案数字化、网络化等现代化建设与管理工作；负责组织档案的鉴定销毁工作。