（一）综合科（规划财务科）。负责机关的党群、机构编制、干部人事等工作；负责机关日常运转，承担信息、安全、保密、档案、政务公开等工作；承担规范性文件的合法性审查，承担行政执法监督、行政复议、行政应诉等工作；拟订退役军人事业发展规划、年度计划和退役军人管理保障基础设施建设标准；指导和监督退役军人事业资金管理；承担机关财务、资产管理、内部审计和退役军人事务系统信息化建设、统计等工作。
（二）优抚科（拥军褒扬科）。负责现役军人、退役军人、军队文职人员、军属和其他优抚对象的优待、抚恤等工作；承担不适宜继续服役的伤病残军人相关工作，组织协调落实退役军人医疗保障工作，拟订有关退役军人医疗、疗养、养老等优抚保障机构的规划政策并指导实施；会同有关部门拟订退役军人特殊保障政策并组织落实；拟订国民党抗战老兵等有关人员优待政策并指导实施；组织指导全市拥军优属工作，承担市拥军优属拥政爱民工作领导小组办公室的日常事务工作，指导做好地方支持军队相关工作；承担烈士褒扬、纪念设施管理保护工作，依法承担英雄烈士保护相关工作，审核拟列入市级重点保护单位的烈士纪念建筑物名录，拟订军人公墓建设规划、管理维护等政策并指导实施，负责烈士评定的审核上报工作，指导开展英雄烈士纪念活动；承担退役军人舆论宣传工作；组织协调走访慰问活动；组织指导军供服务保障工作；协调指导驻启部队随军随调家属就业创业。
（三）移交安置科（就业创业科）。拟订计划分配的军队转业干部、符合条件的退役士兵年度安置计划、教育培训计划并组织实施；按政策协调计划分配的军队转业干部、符合条件的退役士兵随调配偶接收安置工作；落实国家、省和南通市下达的计划外选调工作；拟订自主择业军队转业干部、复员干部、自主就业退役士兵就业创业年度计划并组织实施；组织开展就业创业促进和教育培训等工作，指导开展有关中介服务工作；组织协调落实退役军人社会保险等待遇保障工作；负责移交地方的军队离休退休干部、无军籍退休退职职工的移交安置和服务管理工作；组织协调落实移交地方的离休退休军人、符合条件的其他退役军人和无军籍退休退职职工的住房保障工作，管理军休保障单位。
（四）思想政治和权益维护科。承担退役军人思想政治、总结表彰和荣誉奖励工作；负责退役军人信访分类处理工作；配合做好指导退役军人党建工作；监督检查退役军人相关法律法规和政策措施的贯彻落实情况；承担退役军人权益维护和有关人员的帮扶援助工作。