秦潭历史上曾用名秦。它位于启东东北，距汇龙镇近35公里，与吕四镇直线距离为11公里左右。这里有渔港港口，是启东净渔业乡之一，属吕四渔港委员会管辖。秦潭镇为乡政府驻地。

　　这里最早时为白水荡，属胡逗洲、南布洲等沙洲接涨成陆的通吕水脊区东部，盖东布洲北境地，原属南通县。977~984年始为吕四盐场，隶属丰利盐。1024~1032年隶属海门县。自1350年左右到清康熙十一年间，旧海门县四塌四迁，吕四盐场并入通州。1567~1572年间，吕四场有“西连通泰，东极扶桑，北负沧海，南襟长江”之说。嘉庆十一年（1806年）时，倒岸以南已出现一些沙洲。东至黄海为新淤。1870年时，沙洲之间、沙洲与新淤之间尚存夹江。1905年，已出现一片平原。倒岸北是早期开发地区，北至沧海。其中沈公堤以北为盐灶地，秦潭灶地也在其内。

　　明末清初，秦潭地是个江潮海浪奔驰来往的海口。南端称为寥角嘴，吕四八景之一的寥角嘴分潮就在这个地方。东为孤悬海上的秦潭大河营，南为秦地新港洪，北海滩为海神庙。

　　古时江海岸变迁的特点是北坍南涨，向东延伸，呈三角形半岛楔入海中。同治光绪年间，江水西移，丁荡、牧圩一带涨连得把秦潭至头甲岸连成一片，从此再也不见头甲岸的寥角分潮了。据一些老人回忆，自民国初期至今，现秦潭以东已塌地30多里。

　　秦潭之名的由来众说纷纭，至今实无确凿根据来考证其名。现将几种传说略述如下：

　　一、据通州直隶州志卷七军政志，置海门新义营驻寥角嘴。海防道熊尚文阅兵海门，见寥角嘴半插海中，藏奸甚易，乃置新义营以镇之。明嘉靖中叶设立重镇。清顺治置料（寥）哨军寨四，一屯大河口，一屯寥角嘴，一屯徐稍港，一屯石港，管寨千户各一员，兵各一千（实250人），隶扬州卫指挥统辖。派驻寥角嘴的驻军称巡团，遂演化为秦团。当地方言“巡团”“秦潭”同音。古时秦潭的寥角分潮气势雄伟，吸引不少诗人留下很多诗文。今秦潭之名存而秦潭原址早已坍没海中。

　　二、从“东到尽头西到街”一口语中而得此名。所谓“尽头”，即指人们一路向东抵达水陆交界处。而这交界处正是此地。大凡由于与“秦潭”音同义异而得名。（吕四方言“尽头”、“秦潭”同音）。

　　三、相传明朝正德皇帝一次在海上航行，恰遇狂风恶浪，全船人几乎全被淹死。唯有他怀抱独木幸存，随波逐浪飘泊此地，来到一家姓秦的人家，探潭寻找淡水解渴。“秦潭”一名由此传开。

　　四、清乾隆皇帝一日乘船南下，途经此地，派员上岸寻觅淡水解渴。取其“寻淡”两字为词（与秦潭音同义异）而得名。

　　秦潭镇是1986年左右被命名的。在这以前，虽不称镇，但称名秦潭的历史较长，而且有一定市面。