一、市公安局设下列内设机构：

办公室、人事科（老干部科）、宣传科、组教科、警务辅助人员管理办公室、人民警察培训学校、警务保障室、审计室、信访办、政治安全保卫大队、单位内部安全保卫大队、治安警察大队、交通警察大队、刑事侦查大队、经济犯罪侦查大队、出入境管理大队、监管大队（启东市看守所）、启东市拘留所、网络安全保卫大队（信息通信处）、法制大队、督察队（作风办）、食品药品和环境犯罪侦查大队、巡特警大队、水上警察大队、指挥中心（科技情报大队）、政务服务管理大队

二、根据区域划分和工作需要，市公安局设17个公安派出所：

汇龙镇中心派出所、合作中心派出所、南阳中心派出所、吕四港镇中心派出所、城西派出所、开发区派出所、北新派出所、启隆派出所、王鲍派出所、寅阳派出所、惠萍派出所、东海派出所、海复派出所、近海派出所、吕四港海防派出所、连兴港海防派出所、塘芦港海防派出所